Le caratteristiche fisiche delle tartarughe mature che possono indicare il sesso sono la forma del fondo del guscio, lo spessore della coda, la lunghezza degli artigli, il colore degli occhi e la posizione dell'ano. Il fondo del guscio è normalmente ricurvo verso l'interno sui maschi e piatto o ricurvo verso l'esterno sulle femmine.
La coda di una tartaruga di sesso maschile è generalmente più spessa alla base di quella di una femmina, e gli artigli anteriori e posteriori sono più lunghi anche per i maschi. I maschi possono anche avere una sfumatura arancione o rossa per i loro occhi rispetto alle femmine i cui occhi sono generalmente marroni. Infine, l'ano sulle tartarughe mature si trova oltre il bordo del guscio, mentre per le femmine è normalmente nascosto.
Poiché gli organi sessuali delle tartarughe si trovano all'interno del guscio, è estremamente difficile dire al genere di una giovane tartaruga. Potrebbero volerci fino a quattro anni perché una tartaruga raggiunga la maturità sessuale e poi altri 16 anni prima che raggiunga l'età adulta. La durata della vita di una tartaruga scatola è molto lunga. Ad esempio, la tartaruga a scatola orientale può vivere fino a 40 anni in natura e 100 anni o più in cattività.