Le carte Pokémon più rare sono le schede di Pikachu Illustrator. Ne esistono solo quattro nel mondo e una di recente è stata venduta su eBay per $ 100.000.
Altre carte Pokémon rari includono le carte Allenatore Numeri 1, 2 e 3; le carte Raichu pre-rilascio; e le carte Tropical Mega Battle 2001. La rarità delle carte Trainer Numbers 1, 2 e 3 è dovuta a una che viene rilasciata ogni anno durante le World Finals TCG. Gli editori limitano le carte Raichu pre-rilascio a 10-15 carte in tutto il mondo, con un valore stimato di oltre $ 10.000 per carta. Gli editori limitano le carte Tropical Mega Battle 2001 a 12, quindi vendono per oltre $ 10.000.