I giocatori non possono prendere Kyogre in-game in Pokémon Soul Silver. Tuttavia, i giocatori possono trasferirlo tramite Pal Park da una serie di altri giochi Pokémon.
In Pokémon Cuore d'Oro, i giocatori possono trovare Kyogre nella Torre Incorporata, accessibile da una caverna nella Route 47 se i giocatori hanno il Blue Orb. Quando i giocatori raggiungono lo stesso punto in Soul Silver con il Globo Rosso in loro possesso, trovano invece Groudon che li aspetta.
I giocatori possono ottenere Kyogre in Soul Silver solo facendo trading per lui o importandolo da un'altra partita. Kyogre è disponibile dalla Caverna delle Origini in Pokémon Sapphire, o dalla Grotta Marina in Pokémon Smeraldo. Dal momento che questi giochi erano disponibili solo per Game Boy Advance, tuttavia, richiedono un modello di Nintendo DS con lo slot della cartuccia appropriato. I giocatori che hanno un modello DSi o 3DS non potranno ottenere Kyogre in questo modo e devono scambiare per lui o usare una copia di Heart Gold.
Kyogre è un Pokémon leggendario, e in tutti i giochi inizia al livello 50. I giocatori dovranno essere ad un livello abbastanza alto per vincere la battaglia, e dovrebbero venire preparati a forti attacchi di ghiaccio e acqua.