Per ottenere il personaggio di Mewtwo nel videogioco "Crystal Pokémon", il giocatore deve scambiare per lui usando Time Capsule o ottenerlo tramite un evento. Non può essere catturato come gli altri personaggi in il gioco.
Time Capsule consente a un giocatore che usa "Pokémon Crystal" di scambiare personaggi con altri usando un gioco Pokémon di prima generazione, o con la propria copia di un gioco del genere. I giochi di prima generazione sono "Pokémon Blu", "Pokémon Rosso" e "Pokémon Giallo". Inoltre, in Giappone, "Pokémon Green" fa parte della prima generazione. Il file di salvataggio nel gioco di prima generazione deve avere Mewtwo per tradurlo in "Pokémon Crystal".
Nintendo, l'editore del gioco, regala anche personaggi ai giocatori in occasione di eventi ufficiali. Questo è l'unico modo ufficiale per ottenere Mewtwo nel gioco "Pokémon Crystal".
