In Pokémon Emerald, prendi Cyndaquil parlando con il Professor Birch dopo aver completato la voce Pokémon di Hoenn. Offre uno dei tre Pokémon iniziali della Generazione II: Chikorita, Cyndaquil o Totodile. Questa è solo una caratteristica di Pok? Mon Emerald; i giocatori non ricevono la stessa ricompensa per aver completato il Pokélyx in Pokémon Rubino e Zaffiro.
Il Pokémon di Hoenn contiene 202 Pokémon, 135 dei quali sono stati introdotti nella terza generazione. Per completarlo, i giocatori devono possedere tutti i Pokémon presenti nel gioco, inclusi i tre Pokémon iniziali: Treecko, Torchic e Mudkip. Poiché i giocatori possono scegliere solo uno di questi all'inizio del gioco, completando il Pokélyx è necessario scambiare Pokémon con altre copie di Pokémon Rubino, Zaffiro o Smeraldo.
Inoltre, ci sono cinque Pokémon nella Pokémon di Hoenn che non compaiono in Pokemon Emerald che devono essere scambiati dalle versioni Ruby e Sapphire: Meditite, Medicham, Roselia, Zangoose e Lunatone. < /p>
Ci sono anche il leggendario Pokémon Jirachi e Deoxys, che non appaiono in nessun gioco di terza generazione senza connessioni ad altri giochi o attraverso oggetti ricevuti in eventi speciali del mondo reale. Jirachi è disponibile solo sul disco bonus Pok? Mon Colosseum, completando il gioco Pok? Mon Channel o tramite speciali omaggi. Deoxys si trova solo nel gioco su Birth Island, che richiede un biglietto Aurora da un evento Nintendo per accedere.