Il cotone Bt è una versione geneticamente modificata della pianta che contiene geni per un insetticida. Le piante di cotone includono il Bacillus thuringiensis (Bt), un batterio che forma spore che produce proteine di grido. Quando gli insetti mangiano queste piante di cotone, le proteine del grido si legano alle cellule all'interno dell'insetto, disturbando il flusso di potassio attraverso l'insetto, eventualmente uccidendolo. Il cotone Bt è prodotto da Monsanto e coltivato in India.
La famiglia dei batteri Bt contiene 200 proteine dannose per molti insetti, in particolare scarafaggi, larve di farfalle, vermi di cotone, mosche e larve di falena. Nelle aree in cui questi parassiti rappresentano la principale minaccia per il cotone, l'uso del cotone Bt riduce la necessità di utilizzare insetticidi ad ampio spettro sulle colture. Tuttavia, Bt è inefficace contro altri parassiti, tra cui afidi e insetti puzzolenti. In alcune aree della Cina, l'uso di insetticidi è stato aumentato a livelli pre-Bt nei campi di cotone a causa della necessità di combattere questi parassiti resistenti al Bt.
Negli Stati Uniti, l'uso del cotone Bt ha prodotto circa il 5% in più per acro rispetto al cotone standard tra il 1996 e il 1998.
Il cotone Bt è diffuso in India, la seconda nazione produttrice del mondo. Tuttavia, poiché i semi di cotone Bt della Monsanto sono costosi e non durano oltre una generazione, gli agricoltori indiani hanno sviluppato una propria varietà con semi riutilizzabili. Sebbene l'uso del cotone Bt sia controverso in India, l'83% del cotone del paese proviene dal 2012.
