I leggendari cani, Raikou, Entei e Suicune, cominciano a comparire casualmente nell'erba selvatica una volta che il giocatore ha sconfitto i Quattro Elite e ottenuto l'accesso al traghetto Sevii Island. Il giocatore può catturare solo uno dei tre in una determinata partita, e dipende dal Pokémon iniziale.
Se il giocatore sceglie Squirtle come Pokémon iniziale, appare Raikou nel gioco. Se il giocatore sceglie Bulbasaur come antipasto, appare Entei; per Charmander, è Suicune. Tutti i cani leggendari sono trovati casualmente in erba selvatica e la loro posizione cambia ogni volta che il giocatore entra in un edificio o si sposta in una nuova area. Il modo migliore per trovarli è viaggiare su e giù per alcuni dei percorsi a più aree nel gioco.