Tutti i corpi idrici sulla terra sono biomi acquatici. I biomi acquatici sono il più grande di tutti i biomi, perché l'acqua copre circa i tre quarti del pianeta e sono divisi in due grandi categorie: marino e d'acqua dolce.
I biomi marini sono acqua salata e comprendono oceani, estuari e barriere coralline. Questi biomi ospitano innumerevoli specie di vita animale e vegetale. La maggior parte dell'ossigeno del mondo è fornito da alghe che si trovano nella regione marina. Gli oceani sono il più grande bioma marino. I biomi oceanici sono divisi in quattro sottocategorie: intertidale, pelagico, abissale e bentonico. Le barriere coralline si trovano in acque marine poco profonde e calde. Gli estuari si formano quando l'acqua dolce sfocia nell'acqua salata, risultando in un ecosistema acquatico diverso.
I biomi di acqua dolce comprendono laghi, fiumi, stagni, paludi e zone umide che contengono una minore concentrazione di sale rispetto ai biomi marini. Laghi e stagni sono molto più piccoli degli oceani e ospitano solo una minima parte delle specie che si possono trovare negli oceani. Questi corpi idrici sono divisi in due sottocategorie di biomi: la zona litoranea e la zona limnetica.
Le zone umide includono radure, paludi e acquitrini. Si tratta in genere di corpi idrici molto grandi e sede di una grande varietà di piante e animali acquatici. Fiumi e torrenti fanno anche parte del bioma di acqua dolce. Poiché questi corpi idrici sono in costante movimento, le specie animali e vegetali sono estremamente diverse e variano in base alle condizioni e alla temperatura dell'acqua.