I pinguini si riproducono come la maggior parte degli uccelli, con la fecondazione interna che si ottiene mettendo insieme le cloaca di ciascun pinguino. Lo sperma maschile sperma nella cloaca della femmina dove può quindi viaggiare dentro e concimare le uova.
L'uovo deve essere tenuto al caldo e protetto per la schiusa. Di solito il maschio veglia sull'uovo e vi si siede per la maggior parte del tempo finché non si schiude, mentre la femmina esce in cerca di cibo.
Diversi tipi di pinguini hanno una stagione riproduttiva diversa. La maggior parte dei pinguini si riproduce durante la primavera e l'estate dell'Antartico, ma alcune specie, come i pinguini imperatori, si riproducono da giugno ad agosto, che è l'inverno antartico.