La cromatografia liquida a gas coinvolge la vaporizzazione e l'iniezione di un campione sulla parte superiore della colonna del cromatografo. Successivamente, il campione passa attraverso la colonna come risultato del flusso di gas mobili, mentre il la colonna stessa ha una fase liquida stazionaria che si adsorbe su una superficie solida inerte. A questo punto, è possibile utilizzare diversi rivelatori che offrono diversi tipi di selettività.
È importante che il gas di trasporto sia inerte chimicamente e che i gas usati frequentemente includano elio, azoto, anidride carbonica e argon; la scelta specifica dipende generalmente dal tipo di rilevatore in uso.
Il campione dovrebbe entrare nella colonna come "tappo" del vapore, poiché un'iniezione più lenta di campioni più grandi indebolisce la risoluzione e allarga la banda. Più comunemente, una microsiringa inietta il campione in una porta del vaporizzatore attraverso un setto di gomma sulla testa della colonna.
Per creare risultati precisi, è importante controllare le temperature all'interno della colonna entro un decimo di grado, ma la temperatura ottimale varia con il punto di ebollizione del campione. Una temperatura appena sopra l'eccesso medio del campione produce un tempo di eluizione compreso tra due o tre minuti e mezz'ora. I campioni con un'ampia gamma di ebollizione tendono a rispondere bene alla programmazione della temperatura.