I test biochimici sono i test più rapidi e facili per identificare i batteri perché utilizzano principi deduttivi per ridurre il numero di specie possibili presenti molto rapidamente. Inoltre, poiché i batteri sono microrganismi, l'identificazione visiva non è sempre possibile e non è mai facile Il test genetico è possibile per alcuni batteri ben noti, ma è costoso e richiede tempo.
Un semplice test biochimico per i batteri è il test della catalasi. Uno dei modi migliori per ridurre il pool di potenziali specie di batteri è determinare se la specie in questione è anaerobica, ovvero che non utilizza l'ossigeno nel suo metabolismo. Per eseguire il test, i tecnici espongono una diapositiva carica di batteri a una piccola quantità di perossido di idrogeno. I tecnici quindi osservano il vetrino con l'aiuto di un microscopio per cercare segni di bolle. Le bolle indicano che i batteri sono in grado di metabolizzare l'ossigeno e non sono batteri anaerobici.
I microbiologi hanno a disposizione molti test biochimici diversi che possono aiutarli a dedurre l'identità dei batteri. Spesso, è necessario più di un test per identificare positivamente un campione. La fonte dei batteri può fornire molti indizi sulla sua identità. I tecnici che testano regolarmente campioni simili spesso diventano abili nell'usare la minor quantità possibile di test.