Elizabeth Proctor fu accusata da Mary Warren di essere una strega durante i Prove di streghe di Salem nel 1692. Era incinta in quel momento, quindi non fu giustiziata al momento stabilito. Una volta nato il bambino di Elizabeth, i processi alle streghe erano finiti e lei fu perdonata.
Secondo la Guida della città di Salem Massachusetts, Elizabeth Proctor fu denunciata come strega il 28 marzo 1692. L'11 aprile, quando Elizabeth e Sarah Cloyce furono esaminate in tribunale da diversi funzionari della città, tra cui il vicegovernatore Thomas Danforth e il capitano Samuel Sewall, entrambe le donne sono state accusate di stregoneria e imprigionate.
Elizabeth Proctor rimase in prigione a Salem fino all'inizio di agosto, quando fu processata per stregoneria e condannata. Le altre streghe accusate in tribunale quel giorno, incluso il marito di Elizabeth, John, furono impiccate sulla famigerata Gallows Hill, ma a Elizabeth fu concessa una sospensione temporanea dell'esecuzione perché era incinta.
Quando Elizabeth Proctor partorì, i Prove di streghe di Salem erano finiti. Elizabeth fu condannata e liberata dal carcere. Ma, secondo la legge, era ancora un criminale condannato. Ciò impediva a Elizabeth di rivendicare la proprietà di suo marito John Proctor. Questo includeva la taverna di famiglia che lei gestiva da molti anni. Nel 1697, cinque anni dopo i Witch Trials, un tribunale di successione ripristinò la dote di Elizabeth Proctor.
Il 17 dicembre 1710, Elizabeth Proctor ricevette 578 sterline e 12 scellini in restituzione per la morte di suo marito, John.