Il significato di "genotipo" è la composizione genetica interna di un organismo o di una cellula. La composizione genetica di un organismo determina le sue caratteristiche fisiche e predice le caratteristiche fisiche della sua progenie.
Il termine "genotipo" viene tipicamente utilizzato in riferimento a una caratteristica specifica. Essenzialmente, il genotipo si riferisce a tutti i geni portati da un organismo, indipendentemente dal fatto che questi geni siano espressi. Gli organismi che si riproducono sessualmente hanno tipicamente due copie di un gene specifico. In alcuni casi, un gene può essere recessivo ad un altro gene della controparte, il che significa che se il gene della controparte è presente, viene espresso al posto del gene recessivo. Pertanto, è possibile che un organismo porti un gene recessivo senza esprimerlo, e sebbene il gene non sia fisicamente apparente, può essere trasmesso alla progenie futura. Si dice che l'organismo abbia un tratto recessivo.