È possibile inserire brani su un iPod senza iTunes utilizzando altri software che consentono il trasferimento di musica da un computer al dispositivo. Ci sono alternative a iTunes disponibili per Windows, Linux, e sistemi OSX.
Esistono opzioni software di terze parti per i possessori di iPod che desiderano trasferire musica sul proprio dispositivo senza utilizzare iTunes. Queste opzioni richiedono agli utenti di scaricare il software sul proprio computer. Collega l'iPod e attiva il software installato. Le opzioni freeware come SharePod o PodTrans consentono all'utente di vedere copiare o spostare file musicali da un computer Windows sull'iPod. Podworks e PodUtil hanno lo stesso scopo rispettivamente per OSX e Linux. Ogni programma ha un'interfaccia attraverso la quale gli utenti selezionano la posizione della musica sul proprio computer, se vogliono copiarlo o trasferirlo e dove vogliono salvarlo su iPod.
