Gli alligatori in realtà non respirano sott'acqua. Sebbene possano rimanere sommersi per lunghi periodi di tempo, alla fine devono affiorare per respirare attraverso le narici sul loro lungo muso.
Tra i molti adattamenti riusciti che hanno permesso agli alligatori di rimanere in gran parte immutati nel corso di migliaia di anni è la capacità di rimanere sommersi per più di un'ora alla volta. Questa abilità è aiutata dal cuore del coccodrillo, che rallenta quando l'animale si immerge, consentendo al corpo di usare l'ossigeno in modo più efficiente. Non respirare nell'acqua è essenziale per la sopravvivenza del coccodrillo. In effetti, questo rettile di grandi dimensioni ha delle alette del naso adattate che si bloccano e impediscono all'acqua di entrare quando l'alligatore si immerge sott'acqua.