Uniqlo è stata fondata a Hiroshima, in Giappone nel 1984. Nata come negozio di abbigliamento casual, il suo nome è "Unique Clothing Warehouse". Uniqlo è stata fondata come parte della società Fast Retailing ed è stata scorporata in una sussidiaria interamente controllata da Fast Retailing prima della sua espansione internazionale.
La società madre di Uniqlo, Fast Retailing, si chiamava Ogori Shoji fino al 1991. Ogori Shoji fu fondata nel 1949 a Yamaguchi, in Giappone. Prima della fondazione di Uniqlo, Ogori Shoji vendeva abiti da uomo attraverso la catena di negozi Men's Shop. Uniqlo è stato il primo negozio di abbigliamento unisex della società.
Il negozio è stato fondato per fornire abbigliamento adatto a tutti gli stili. I progetti di Uniqlo erano pensati per essere semplici, in modo che i clienti potessero adattarli ai guardaroba e agli stili esistenti. I prodotti Uniqlo dovevano essere indipendenti dalle tendenze della moda e dalle differenze di stile tra gruppi di età, generi e regioni.
Uniqlo si espanse prima al di fuori del Giappone nel 2002. I negozi internazionali originali erano in Cina e nel Regno Unito. L'azienda si è espansa negli Stati Uniti, a Hong Kong e in Corea del Sud nel 2005 e in Malesia nel 2010. Sono state aperte anche sedi Uniqlo in Australia, Bangladesh, Francia, Macao e Indonesia, nonché nelle Filippine, in Russia, a Singapore, a Taiwan e Thailandia.
