Non sono necessari strumenti per pulire i miscelatori Ninja. Il Mega Kitchen System, il frullatore Professional, il Nutri Ninja e il frullatore Ultimate richiedono tutti gli stessi metodi di pulizia. La base del motore viene pulita con un panno umido e le brocche, i coperchi, le lame e gli accessori sono lavabili in lavastoviglie.
Mentre il brocca viene pulito sul cestello inferiore della lavastoviglie, i pezzi più piccoli vengono posizionati sul cestello superiore. Un altro modo per pulire un frullatore Ninja è riempirlo per tre quarti con acqua tiepida, aggiungere una piccola quantità di detersivo per piatti, metterlo sul coperchio e premere PULSE diverse volte. Dopo che il frullatore è pulito, tutti i componenti sono sciacquati sotto l'acqua corrente. Il frullatore non deve essere conservato finché i pezzi non si sono asciugati completamente.
