Peanut the Royal Blue Elephant, Coral Casino the Bear, Trappola il topo e Slither the Snake sono alcuni dei più rari e alti dollari da collezione TY Beanie Babies. Altri rari Beanie Babies includono Pechino il Panda, Senna-Kun il Cane, Softbank Hawks l'Orso e l'Orso di Hong Kong. Di questi rari TY Beanie Babies, quelli che raggiungono il prezzo di vendita più alto includono il cartellino originale ancora apposto.
Rex the Dinosaur, Steg the Dinosaur, Bronty the Dinosaur e Caw the Black Crow sono anche rari Beanie Babies da collezione. In ciascuna delle tre generazioni di Beanie Babies, ci sono molti animali rari che comandano prezzi elevati quando erano in ottime condizioni. Bumble the Bee, Dusty the Bear, Lucky the Ladybug, Manny the Manatee e Princess the Bear sono altri Beanie Babies che sono meno rari di alcuni degli altri, ma comunque hanno un prezzo considerevolmente più alto del loro prezzo di acquisto originale.
Molti dei rari Beanie Babies da collezione sono in commemorazione di un particolare evento ed erano disponibili solo per l'acquisto all'evento, rendendo la loro uscita ancora più limitata. I Beanie Babies, ancora più rari, sono animali a breve scadenza che sono stati interrotti o modificati, limitando la quantità prodotta e aumentandone i costi.