La geografia dell'impero Inca era in gran parte montuosa e occupava gran parte della costa occidentale del Sud America. Una grande parte dell'impero Inca esisteva all'interno di una zona climatica nota come tierra fria.
Al suo culmine l'impero Inca occupava quasi 2.500 miglia lungo la costa occidentale montuosa del Sud America, estendendosi dall'attuale Quito, Ecuador a sud a Santiago, in Cile. La principale caratteristica geografica di questa regione è la Cordigliera delle Ande, una zona ricca di diversità geografica. La regione andina dell'America del Sud ha una copertura geografica che va dal deserto alla foresta pluviale al ghiacciaio. Dalle montagne stesse, ad ovest alla costa, è una regione di deserti. Le oasi rendono la vita possibile in questa regione arida, ma l'impero Inca includeva uno dei deserti più brutali della Terra - l'Atacama - parti delle quali non hanno avuto precipitazioni nella storia umana registrata.
Le pianure delle Ande sostengono le foreste pluviali tropicali e le savane, mentre le altitudini più elevate diventano foreste nuvolose. Le foreste nuvolose sono fresche e umide, con un velo di copertura nuvolosa che prevale quasi 300 giorni all'anno. Il clima qui supporta la vegetazione e la fauna selvaggia che non si trovano da nessun'altra parte sulla Terra.
Una caratteristica importante dell'impero Inca è il Lago Titicaca, tra le nazioni odierne del Perù e della Bolivia. Il lago Titicaca si trova all'interno di una zona climatica conosciuta come la tierra fria. La geografia e il clima unici del lago forniscono alcuni dei migliori terreni agricoli della regione.
