Le lucertole, come molti vertebrati, hanno polmoni e un sistema respiratorio che consente loro di respirare. Sono diversi dai mammiferi e dagli uccelli in quanto non hanno un muscolo del diaframma e invece respirano flettendo i muscoli del loro corpo.
Dal momento che hanno bisogno di usare i loro muscoli per respirare, le lucertole in genere trattengono il respiro mentre svolgono attività intense. Alcune lucertole possono bypassare questa limitazione usando i loro muscoli della gola per tirare aria nei polmoni durante l'attività.
Non tutti i rettili usano la respirazione basata sul muscolo. Coccodrilli e tartarughe hanno sviluppato diversi metodi per respirare. I coccodrilli hanno un diaframma che consente loro di inalare l'aria, mentre le tartarughe, la cui espansione polmonare è limitata dai loro gusci, hanno uno strato muscolare sottile che giace sui loro polmoni e si espande e si contrae per portare aria.
