Lo studio dei batteri è il soggetto di una branca della microbiologia chiamata batteriologia. La batteriologia è ulteriormente suddivisa in diverse sottodivisioni che si concentrano sui batteri in ambienti specifici, come la batteriologia marina e industriale.
Con l'avvento del microscopio, gli scienziati hanno iniziato a studiare gli organismi chiamati batteri. Tra il 1853 e il 1872, Ferdinand Cohn classificò la morfologia di molti batteri. Tuttavia, è stato il lavoro degli scienziati Robert Koch e Louis Pasteur a fare la connessione tra i batteri ei processi di fermentazione e malattia. Lo sviluppo di farmaci per combattere le malattie causate dai batteri ha portato alla fondazione del ramo della medicina noto come immunologia.
