Il moderno Chihuahua a pelo corto è nato a Chihuahua, in Messico, negli anni 1850. Le antiche origini della razza sono discusse, ma gli storici credono che i Chihuahua siano stati scoperti in Messico, Centro America o Sud America.
Una teoria suggerisce che i Chihuahua siano discesi dal cane Techichi sudamericano, che è stato raffigurato in incisioni Tolteche del IX secolo. Le illustrazioni di Techichis ritraggono caratteristiche simili ai Chihuahua, comprese le teste rotonde e le grandi orecchie. La popolazione di Techichi fu assimilata alla cultura azteca dopo la conquista dei Toltechi, ma gradualmente si assottigliò durante la conquista spagnola. Gli Aztechi credevano che i cani di Techichi fossero guide chiaroveggenti del mondo sotterraneo e li lodavano come simboli di misticismo e guarigione.