Secondo Vetstreet, i Chihuahua vivono da 12 a 20 anni. I Chihuahua sani hanno una delle più lunghe esistenze di una qualsiasi razza di cani. Sono anche la razza più piccola e l'unica razza di taglia naturale.
Mentre il Chihuahua può godere di una lunga vita, ci sono molti problemi di salute che tendono ad affliggere questi cani. Come molti piccoli cani, i chihuahua possono sviluppare il collasso tracheale, che causa un grave ostruzione alle vie respiratorie. Molti chihuahua hanno una molera, un punto morbido aperto sul cranio che non si chiude mai completamente, il che può portare a ferite alla testa, convulsioni e morte. Alcuni chihuahua hanno uno shunt portosistemico, un difetto alla nascita che fa deviare il sangue dal fegato e porta a un letale accumulo di tossine.