Di notte, gli scoiattoli concludono le loro attività ritirandosi nei nidi, che sono costruiti principalmente sugli alberi. Come gli uccelli, la maggior parte degli scoiattoli costruisce nidi per fungere da case, che usano per allevare giovani e riposare. Molti costruiscono le loro abitazioni sui rami degli alberi, anche se alcuni si riparano nelle cavità degli alberi situate in alto nei tronchi degli alberi.
Alcuni scoiattoli, come i gufi e gli uccelli più grandi, si riparano nelle cavità degli alberi o nelle tane quando cala la notte. Molte specie, come il grigio, la volpe e gli scoiattoli rossi, hanno più probabilità di riposare in questo modo. Questi scoiattoli possono rendere confortevoli le loro abitazioni aggiungendo materiale da letti morbidi, come foglie e muschio. Gli scoiattoli possono costruire nidi temporanei nei rami degli alberi durante i mesi più caldi in primavera e in estate e le tane di riserva per il letargo invernale. I nidi stagionali a breve termine, chiamati drays, permettono agli scoiattoli di dormire e crescere i loro piccoli. Questi dormitori, come le tane, sono spesso fortificati con foglie e ramoscelli e si trovano verso la parte del tronco di alberi più grandi. Mentre quasi tutti gli scoiattoli vanno in letargo durante l'inverno, solo quelli che vivono in luoghi caldi si estinguono, o vanno in letargo, durante l'estate. Invece di nidificare sugli alberi, tuttavia, gli scoiattoli scavano le tane sotto la superficie della Terra per sfuggire ai torridi raggi estivi.
