Il giaguaro non ha predatori naturali, secondo la Rainforest Alliance. Gli esseri umani sono la principale minaccia per i giaguari, il bracconaggio e la perdita di habitat naturale.
I giaguari vivono in molti habitat diversi, sebbene si trovino il più delle volte nelle giungle e nelle foreste. La perdita degli habitat naturali ha portato ad un aumento del contatto con gli umani, che uccidono i giaguari per le loro pellicce, sebbene questa pratica non sia così comune come una volta. La Rainforest Alliance afferma che ora ci sono all'incirca solo 15.000 giaguari rimasti in libertà. I giaguari cacciano anche alcune delle stesse specie umane, favorendo il pericolo di contatto umano.