Alcune specie di pipistrelli sono in letargo, e altre sono attive tutto l'anno. I pipistrelli che vivono nelle aree in cui gli insetti muoiono durante l'inverno tendono ad andare in letargo a causa dell'esaurimento delle risorse alimentari e dei pipistrelli nelle aree tropicali con la preda affidabile per tutto l'anno non è in genere ibernata.
I pipistrelli si arrotolano nelle palle mentre sono in letargo e di solito vanno in letargo sulle pareti o sui soffitti delle caverne. Alcune specie di pipistrelli sono in letargo per un massimo di sei mesi, sussistendo solo pochi grammi di riserve di grasso. La loro capacità di abbassare la temperatura corporea e rallentare il metabolismo e la frequenza cardiaca consente loro di ibernare per così tanto tempo. I pipistrelli in genere perdono circa la metà del loro peso corporeo totale durante il letargo.