Sebbene la FDA non abbia eliminato alcun disinfettante liquido che usi l'alcol come suo principale agente per l'uso in ambito clinico, l'alcol isopropilico si è dimostrato efficace nell'uccidere i microorganismi in determinate condizioni, secondo il Centers for Disease Control and Prevention. Tra i diversi tipi di alcol disponibili per la sterilizzazione, l'alcol isopropilico è costantemente uno dei più battericidi.
Come riportato dal CDC, sono stati condotti studi clinici su alcool metilico, alcol etilico e alcol isopropilico per determinare la loro efficacia relativa nelle superfici sterilizzanti. Tutte le forme di alcol hanno subito un calo significativo dell'efficacia se diluite a concentrazioni inferiori al 50%. Nessuno si è dimostrato in grado di uccidere spore batteriche o strati proteici penetranti. Tra le varietà testate, tuttavia, l'alcol isopropilico ha dimostrato la capacità di uccidere i virus sia per l'epatite B che per l'herpes. Era leggermente più efficace dell'alcool etilico per la disinfezione delle popolazioni di E. coli e S. aureus.
È stato anche scoperto che l'alcol isopropilico era efficace nella disinfezione delle teste riutilizzabili dei trasduttori. Il CDC avverte, tuttavia, che i germicidi a base alcolica non sono generalmente raccomandati per la sterilizzazione degli strumenti chirurgici. Questo perché nessuno degli agenti testati è stato in grado di eliminare in modo affidabile le spore di vari bacilli e occasionalmente sono state rilevate infezioni mortali all'uso di strumenti trattati con alcol.
