Il portale più comune di ingresso per i patogeni è il tratto respiratorio. I patogeni entrano attraverso particelle di polvere o goccioline che entrano nel tratto respiratorio. Alcuni agenti patogeni che entrano in questo modo sono i virus noti come influenza, morbillo e varicella-zoster, che causa la varicella.
L'adulto medio può respirare giornalmente circa 21 piedi cubici d'aria, fornendo molte opportunità di infezione. I virus infettano il tratto respiratorio attaccandosi alle cellule e moltiplicando. Alcune delle infezioni più comuni di questa zona sono il comune raffreddore, bronchiolite e polmonite.
Altri portali includono la pelle, il tratto gastrointestinale e il tratto genitourinario. Esempi di infezioni includono parotite, tetano, malaria e AIDS.
