Se eseguita da un chirurgo esperto e qualificato, il tasso di successo dell'operazione Whipple è del 96%, afferma il Centro USC per le patologie pancreatiche e biliari. Il tasso di successo può raggiungere il 99% in strutture che eseguono molte di queste operazioni ogni anno, rileva WebMD.
Il livello di esperienza del chirurgo e la familiarità con la procedura sono i maggiori fattori nel determinare il tasso di successo dell'operazione, afferma l'American Cancer Society. I tassi di mortalità per la procedura di Whipple possono raggiungere il 15% se eseguiti in ospedali più piccoli o da chirurghi meno esperti. La Società consiglia ai potenziali pazienti di cercare centri medici che eseguono almeno 15 operazioni Whipple ogni anno.