La struttura a membrana che contiene enzimi digestivi è il lisosoma. I lisosomi contengono enzimi che scompongono macromolecole organiche come carboidrati, grassi e proteine. Tutte le cellule animali contengono lisosomi, ma sono più presenti nelle cellule del sistema immunitario, come i globuli bianchi.
Circa 40 diversi enzimi digestivi risiedono all'interno di un lisosoma. Questi enzimi sono fatti da organelli chiamati ribosomi che sono attaccati al reticolo endoplasmatico e messi in pacchetti dai corpi di Golgi. L'interno o la matrice di un lisosoma ha un pH acido di circa 4,8, che è l'ambiente ottimale per gli enzimi. Al di fuori del lisosoma, questi enzimi sono resi innocui perché il pH non è acido e non supporta il normale funzionamento degli enzimi lisosomiali.
