Lo pterodattilo medio aveva un'apertura alare di 3 piedi e pesava tra 2 e 10 libbre. Gli pterodattili non erano dinosauri, sebbene entrambi i gruppi appartengano allo stesso gruppo scientifico, gli archosauri.
Gli pterodattili volavano rettili con membrane simili a pipistrelli che si estendevano sugli arti anteriori. Sebbene alcune persone possano usare i termini "pterodattilo" e "pterosauro" in modo intercambiabile, gli pterosauri erano il gruppo dominante a cui gli pterodattili erano semplicemente membri. Alcuni pterosauri sono cresciuti a grandi dimensioni, con altezze paragonabili alle giraffe.
Gli pterodattili sembrano essere tra i membri più piccoli del gruppo degli pterosauri. Tuttavia, dal 2015, gli scienziati non hanno portato alla luce alcun esemplare di pterodattilo adulto fossilizzato, quindi è possibile che individui completamente cresciuti abbiano superato l'apertura alare e il peso attualmente noti. Ci sono attualmente due specie di pterodattili ampiamente riconosciute: Pterodactylus antiquus e Pterodactylus longicollum. Di questi, il Pterodactylus longicollum è il più grande.