Le alternative ai sistemi settici domestici tradizionali includono filtri a ricircolo di sabbia, bagni di compostaggio, sistemi settici di traspirazione per evaporazione e sistemi aerobici. Se questi o altri metodi alternativi costano meno dei sistemi tradizionali, dipende da numerosi fattori, come le dimensioni della casa, i regolamenti locali e le tariffe praticate dagli appaltatori locali.
I metodi alternativi di trattamento dei rifiuti possono essere simili ai sistemi settici tradizionali, come i sistemi di acque grigie o metodi che distruggono i rifiuti, come l'incenerimento dei servizi igienici. Ulteriori metodi includono i sistemi a laguna e a letto rialzato.
I sistemi settici aerobici trattano le acque reflue con prodotti chimici disinfettanti, consentendo lo scarico dell'acqua nelle acque sotterranee senza l'uso di una fossa settica.
Le normative in alcune aree proibiscono alcuni tipi di sistemi settici, spesso a causa di livelli di falda o altri criteri di utilizzo del suolo.
