Alcune differenze tra l'ELCA e il Sinodo del Missouri sono la loro comprensione dell'interpretazione biblica, il ruolo delle donne nel ministero e le credenze e le pratiche sacramentali. Mentre entrambe le denominazioni condividono un'eredità luterana, queste differenze hanno portato ad una maggiore divisione tra di loro.
La Chiesa evangelica luterana e il Sinodo del Missouri Chiesa luterana non sono mai stati un corpo unito, poiché il LCMS non è mai stato parte delle organizzazioni che si sono fuse per formare l'ELCA. Le differenze tra i due corpi hanno cominciato ad emergere negli anni '70, con entrambe le chiese che rispondevano in modo diverso ai cambiamenti radicali che si stavano verificando nella società in quel momento.
Mentre entrambe le chiese condividono credenze e confessioni comuni, differiscono nella loro comprensione dell'interpretazione biblica. L'ELCA abbraccia la cultura storico-critica della Bibbia che porta a una varietà di interpretazioni che l'ELCA consente. Il LCMS è più scettico su certe forme di studiosi critici, credendo che possano minare l'autorità biblica.
Nei primi anni '70, l'ELCA iniziò il processo di ordinazione delle donne alla leadership pastorale. Oggi ci sono donne che prestano servizio nel ministero ordinato a tutti i livelli dell'ELCa, mentre la LCMS crede che la Bibbia permetta agli uomini di servire solo come pastori.
Il LCMS consente solo ai membri in regola delle parrocchie della LCMS di ricevere la Comunione nei suoi servizi. L'ELCA consente a qualsiasi cristiano battezzato di ricevere in una chiesa ELCA e ha accordi di piena comunione con un certo numero di altre confessioni protestanti.
