Al di fuori degli esseri umani, le aquile calve hanno pochissimi nemici naturali e le aquile adulte non hanno predatori naturali. I nidi e le uova vengono occasionalmente predati da gabbiani, corvi, falchi, gufi, altre aquile, linci, orsi neri e procioni.
Poiché i nidi d'aquila sono spesso in alto sugli alberi e molto grandi, i carnivori che sono scalatori poveri raramente hanno accesso alle uova e ai giovani, e le aquile calve sono abbastanza premurose per proteggere i loro giovani dai danni nella maggior parte dei casi. Uno scarso accesso al cibo può lasciare i giovani vulnerabili, tuttavia, poiché i genitori devono cacciare più a lungo e più lontano dal nido per provvedere alla loro prole.
