Anche se un mouse richiede pochissimo addestramento ed è il modo più comune per utilizzare un computer desktop, sfortunatamente richiede una superficie piatta e aperta e occupa più spazio rispetto ai metodi alternativi. I mouse sono facili da uso e la maggior parte degli utenti ha familiarità con il modo di operare uno, ma se una scrivania non è disponibile molti utenti preferiranno utilizzare un trackpad.
I mouse spesso richiedono un cavo che può rimanere impigliato o scollegato da dietro il computer, oppure le opzioni wireless possono perdere la connessione e richiedere batterie. Tutti i mouse richiedono una sorta di superficie piatta, che è perfetta per lavorare su una scrivania ma è più difficile da usare su un laptop portatile. I mouse sono facili e coerenti, ma non sono altrettanto versatili come un trackpad.