Il vantaggio principale di includere una GUI con software è che rende più facile per la maggior parte degli utenti imparare e utilizzare l'applicazione. I principali svantaggi sono che utilizza più risorse di sistema, degradando così le prestazioni generali del software. Inoltre, le GUI spesso forniscono all'utente un controllo meno dettagliato delle operazioni.
Una GUI offre agli utenti alle prime armi spunti visivi che aiutano a guidare e fornire un feedback immediato per ogni azione intrapresa. È molto più facile per la persona tipica scoprire e utilizzare funzionalità identificate con un'immagine, come un punto interrogativo per indicare aiuto o un'icona stampante per designare la funzione di stampa. Tuttavia, a causa di questi elementi grafici, il software che utilizza una GUI spesso funziona molto più lentamente delle applicazioni senza quel livello. Inoltre, a seconda del metodo utilizzato per creare la GUI, il software potrebbe non funzionare su computer meno recenti che non dispongono della potenza di elaborazione necessaria o di controlli grafici compatibili.
Il software che richiede all'utente di operare utilizzando un'interfaccia della riga di comando ha generalmente una curva di apprendimento molto più ripida. Tuttavia, una volta che l'utente ha familiarità con i comandi, di solito viene eseguito molto più rapidamente. Un operatore esperto generalmente trova che le opzioni disponibili utilizzando una riga di comando forniscono maggiore potenza e flessibilità nell'utilizzo del software.
