La muffa nei polmoni, una condizione chiamata aspergillosi, è tipicamente trattata con farmaci orali che riducono l'infiammazione, i farmaci antifungini o, nei casi più gravi, la chirurgia. Ogni tipo di aspergillosi richiede diversi metodi di trattamento , secondo Cleveland Clinic.
Una reazione allergica al fungo, chiamata aspergillosi broncopolmonare allergica, può essere trattata con farmaci corticosteroidi orali. Farmaci antifungini possono essere utilizzati per il trattamento di aspergillosi polmonare, in cui la muffa cresce negli spazi anormali di polmoni danneggiati e malati, secondo Cleveland Clinic. La chirurgia è necessaria per trattare le masse fungine chiamate aspergillomi, che possono causare seri problemi e di solito non rispondono ai farmaci antifungini.