L'Oceano Indiano ospita una moltitudine di specie di squali, alcune pericolose per gli esseri umani, altre no. Secondo la Shark Foundation, le specie che vivono in queste acque temperate includono, ma non si limitano a squali blu, squali serici, squali balena, squali tigre, squali tigre, mako a pinne corte, la grande testa di martello, trebbiatrice e grande bianco.
Uno dei più docili e popolari tra gli squali menzionati è lo squalo balena, una specie stimata come il pesce più grande del mondo. Rimane ancora molto da indagare sulla specie, che lo rende un centro attivo di ricerca. Possono essere visualizzati a profondità snorkeling in alcuni locali. Gli squali setosi sono così chiamati per la qualità liscia della loro pelle, una caratteristica che non si trova in nessun'altra specie di squalo. Gli squali blu godono delle temperature miti dell'oceano e sono acuti cacciatori di qualsiasi cosa, dai calamari e gli uccelli agli squali più piccoli. Naturalmente, l'Oceano Indiano è anche la patria di tutti e cinque gli squali che sono stati classificati come i più pericolosi per l'uomo: il grande bianco, tigre, maialino, oceanica e toro.
Oltre a tutte queste varietà, un sondaggio del 2012 ha rilevato che l'Oceano Indiano era sede di un certo numero di squali di mare profondo raramente osservati, compresi i falconii falsi e filetail. In totale, National Geographic ha annunciato che potrebbero essere state scoperte ben otto specie completamente nuove.