Le mucche hanno 60 cromosomi: una singola coppia di cromosomi sessuali e 29 coppie di autosomi. Simile agli altri mammiferi, tutte le femmine hanno due cromosomi X, mentre i maschi hanno una sola Y e X cromosoma.
Secondo il Dipartimento di Animal and Poultry Science dell'Università di Saskatchewan, durante le fasi della gametogenesi, i cromosomi della mucca subiscono un processo di meiosi. Ciò si traduce in una principale cellula riproduttiva che produce tre corpi polari e un uovo. La mucca contribuisce solo uno dei cromosomi X nel processo di meiosi. Tutti i cromosomi sono a forma di lacrima e hanno il centromero alla fine, eccetto i cromosomi sessuali, che caratterizzano il centromero più verso il centro del cromosoma.