L'American Medical Veterinary Association non suggerisce un particolare programma di vaccinazione contro la tosse del canile. Invece, l'organizzazione esorta i proprietari di cani a consultarsi con il loro veterinario per discutere se un singolo cane è a rischio di esposizione ai virus contagiosi e ai batteri responsabili della tosse del canile.
Poiché gli agenti infettivi responsabili della tosse del canile si diffondono attraverso il contatto diretto cane-cane, alcuni cani sono a maggior rischio di contrarre la malattia. PetMD spiega che i cani esposti alle strutture di imbarco e le condizioni simili a quelle del canile presentano i più alti tassi di infezione da tosse del canile. L'esposizione ai cani infetti rappresenta anche un rischio per i cuccioli non vaccinati e per i giovani.
Se un cane è considerato ad alto rischio per la contrazione della tosse del canile, la UC Davis School of Veterinary Medicine suggerisce la somministrazione di un vaccino contro la tosse del canile entro sei mesi dall'imbarco del cane e almeno una settimana prima della data d'imbarco. Dopo l'iniziale, viene somministrato un vaccino monodose, un richiamo ogni sei mesi è sufficiente per una protezione continua. Poiché molti cani non richiedono vaccini per la tosse del canile, una consultazione con un veterinario è il modo migliore per identificare i fattori di rischio di un cane e determinare se trarrebbe beneficio dalla vaccinazione regolare.