Sebbene il silicio elementare sia inerte e non intrinsecamente pericoloso, alcune forme elaborate dell'elemento possono causare effetti negativi sulla salute. Il silicio cristallino irrita gli occhi e provoca il contatto con l'infiammazione della pelle, mentre l'inalazione della sostanza aggrava le mucose dell'apparato respiratorio.
Gli studi suggeriscono che l'esposizione professionale regolare al silicio cristallino e al silicio porta al cancro del polmone, alla bronchite, al disturbo ostruttivo polmonare cronico e all'enfisema. Inoltre, l'esposizione alla silice è legata a malattie autoimmuni e renali nonché a un aumento delle infezioni da micobatteri. Molti ruoli professionali sono a rischio per un'esposizione regolare al silicio tra cui minatori, lavoratori di vasai, fabbricanti di mattoni e altri che lavorano in industrie basate su minerali.
