Le mosche della frutta sono tra i membri più piccoli dei Ditteri dell'Ordine e hanno occhi composti grandi e pronunciati, corpi di forma ovale e una serie di quattro ali, molto simili a mosche più grandi. La frutta vola mediamente circa 1 millimetro di lunghezza e le femmine sono leggermente più grandi dei maschi. Assomigliano molto a molte specie di mosche in apparenza, condividendo la stessa forma del corpo, ali grandi e occhi sporgenti, ma hanno diverse differenze biologiche chiave.
Le mosche della frutta sono separate biologicamente dai loro parenti più prossimi dalle loro ariste pectinate, che sono piccole strutture simili a peli che coprono le loro antenne. I moscerini della frutta battono le loro ali più rapidamente e aggressivamente in volo rispetto ai loro cugini più grandi, il che conferisce loro un caratteristico suono ronzio più acuto mentre vola in aria rispetto alla maggior parte delle altre mosche. Come con gli altri Ditteri dell'ordine, i moscerini della frutta variano a seconda della specie. Alcuni sono vivaci e vivaci e hanno corpi e ali colorati in arancione brillante, cremisi e oro, mentre altri sono blu scuro, grigio e nero. I moscerini della frutta hanno lunghe antenne, che possono essere il doppio della lunghezza del loro corpo. Queste antenne sono dotate di piccoli tastatori all'estremità che guidano le mosche verso le loro riserve di cibo. Le mosche della frutta hanno occhi composti sovradimensionati, come la maggior parte degli insetti, che essenzialmente danno loro una visione tridimensionale
