Gli ippopotami dei cartoni animati sono personaggi disegnati e presentati in film d'animazione o serie TV tipicamente umoristici. Tra i più famosi ippopotami di cartoni animati sono gli ippopotami ballerini nel libro per bambini "Fantasia" e personaggi televisivi George e Martha, ippopotami hip hop Flavio e Marita della serie animata "Animaniacs" e Gloria l'ippopotamo dei film "Madagascar".
Nel film d'animazione del 1940 "Fantasia", Hyacinth l'ippopotamo guida uno stuolo di ippopotami danzanti nel loro tentativo di fuggire dagli alligatori nel numero "La Gioconda".
"George and Martha" era una serie televisiva animata del 1999 basata sui libri per bambini di James Marshall. Nella serie, Nathan Lane e Andrea Martin hanno doppiato un paio di ippopotami migliori amici che hanno avventure facendo cose normali.
Nella serie TV "Animaniacs", Flavio e Marita erano una coppia di ricchi ippopotami spagnoli che a volte vagavano in situazioni pericolose inconsapevoli del pericolo e che erano determinati a fare tendenza.
Gloria è un ippopotamo dei cartoni animati che appare nei film e nei videogiochi del "Madagascar". Doppiato da Jada Pinkett Smith nei film, Gloria è uno degli animali che finisce in un viaggio imprevisto verso l'isola del Madagascar. Nel sequel, Gloria si innamora temporaneamente di un altro ippopotamo dei cartoni animati, Moto-Moto, ma ritorna al suo fidanzato giraffa, Melman.
