Francisco Pizarro scoprì e conquistò l'Impero Inca in quello che poi divenne il paese del Perù. Quando stabilì il primo insediamento dalla Spagna in Perù, San Miguel de Piura, il leader Inca Atahualpa non accettò la presenza degli spagnoli. Di conseguenza, la Battaglia di Cajamarca è scoppiata e Pizarro ha finito per catturare e infine eseguire Atahualpa. In presenza di questo vuoto di leadership, Pizarro è stato semplice a prendere Cuzco, la capitale degli Inca, e portare tutto il Perù in Spagna.
La conquista del Perù da parte di Pizarro e la conquista del Messico da parte di Cortes avvennero all'incirca nello stesso periodo. Il risultato di Pizarro è stato visto come più significativo perché ha portato un minor numero di combattenti, ha assunto eserciti più grandi ed è stato più lontano dagli avamposti di rifornimento spagnoli che hanno dato preziosi aiuti, armi e uomini allo sforzo di combattimento. Pizarro fu assassinato dal figlio del suo ex amico, Diego Almagro, che Pizarro aveva giustiziato dopo una serie di liti e la sanguinosa Battaglia di Las Salinas. Dopo la sua morte, la sua famiglia ha eretto un palazzo in suo onore nella Plaza Major di Truillo. Ancora oggi, rimane un argomento di polemica in Perù visto che molti lo vedono come la causa della distruzione di gran parte della lingua, della cultura e della religione indigene nel paese.
