A partire dal 2015, la fidanzata di Bill Maher è Anjulie Persaud. Sono una coppia dal 2014. Persaud è un cantautore canadese e Nicki Minaj ha eseguito il suo lavoro. Persaud ha scritto un singolo di successo, "Do not Call Me Baby" per Kreesha Turner.
Maher, l'ospite del programma televisivo "Real Time with Bill Maher", non si è mai sposato. Dal 2003 al 2004 esce con Coco Johnsen, ex Playboy Cyber Model. Johnsen lo ha citato in giudizio per 9 milioni di dollari per il dolore e la sofferenza e ha affermato che ha promesso di sposarla. Un giudice ha respinto la causa. Altre fidanzate passate includono la neuroscienziata Cara Santa Maria e la modella hip-hop Karrine Steffans.
