Tra gli alleati di Athena c'erano molti eroi della mitologia greca, tra cui Odisseo, Giasone, Perseo ed Eracle. Poiché si schierò con i greci nella guerra di Troia, i suoi nemici includevano Parigi e gli altri difensori di Troia. Tra gli dei, i suoi avversari includevano Efesto e Poseidone.
Secondo la mitologia greca, Athena ha aiutato Jason ad acquisire il vello d'oro. Aiutò anche Perseo a decapitare Medusa. Ella consigliò ad Eracle di usare gli artigli del leone di Nemea per tagliare la sua pelle inespugnabile, gli diede un sonaglio per spaventare gli uccelli di Stinfalo così da poterli uccidere e aiutarlo ad entrare nell'oltretomba per sconfiggere Cerbero. Atena offrì consigli di Ulisse durante tutta la guerra di Troia, lo protesse nei suoi vagabondaggi, lo guidò a casa e lo aiutò a riconquistare la sua casa e sua moglie.
Un mito greco dice che Afrodite, Era e Atena pretesero tutti di essere la divinità più bella, e Zeus nominò Parigi, un principe troiano, per decidere tra loro. Parigi scelse Afrodite su Atena e ciò indusse Athena a favorire la parte greca nella guerra di Troia. Sebbene sia Ares che Athena fossero rappresentanti della guerra, lei simboleggiava saggezza, intuizione, coraggio, gloria e superiorità morale piuttosto che paura e desiderio di sangue. Anche se Athena è riconosciuta come una dea vergine, è diventata madre. Efesto, figlio di Zeus ed Era, cercò di violentarla, e quando il suo seme cadde dalla sua gamba sulla terra, nacque Erichthonio mezzo-serpente e mezzo uomo. Poseidone divenne l'avversario di Athena a causa di una discussione su chi sarebbe stato il protettore di Atene. Nella loro competizione, ognuno offriva i doni degli Ateniesi. Poseidone offrì agli Ateniesi una fontana di acqua salata, ma Atena vinse offrendo loro un ulivo.
