Rin si uccide eseguendo la tecnica di alleggerimento di Kakashi per evitare di danneggiare il suo villaggio nel numero 604 del manga giapponese "Naruto". Enemy shinobi aveva messo un mostro in lei e pianificato di usarla contro il villaggio.
Il Ninja from the Hidden Mist rapisce Rin e mette i Sanbi dentro di lei. Il Sanbi è un mostro con tre code. Quando Rin torna al villaggio, il Ninja della Nebbia Nascosta aveva pianificato di liberare il mostro per distruggere il villaggio. Rin si uccide per evitare che ciò accada. Kakashi ha una speciale tecnica magica che fa apparire i fulmini sulla sua mano. Rin corre nella mano di Kakashi, le ha fatto un buco nel petto e l'ha uccisa. Lo fa per salvare il villaggio da cui proviene, che si chiama Konoha, o "Villaggio nascosto nelle foglie". Nella prima rappresentazione di questa scena tratta dal manga, sembra che Kakashi uccida Rin stesso con la tecnica. Tuttavia, la vera situazione viene rivelata in seguito. Obito, che era innamorato di Rin, incontra la sua morte troppo tardi per salvarla. Uccide il ninja responsabile dell'uccisione di Rin con i poteri che aveva appena acquisito.
