In una certa misura, gli squali digeriscono il cibo in modo simile agli umani. Il cibo viene portato nello stomaco, dove enzimi e altri bio-agenti lo distruggono. Una volta che questo processo è stato completato, la sostanza risultante viene guidata nell'intestino; tuttavia, il sistema dello squalo ha la capacità di distinguere le cose che ha ingerito ma che non forniscono alcun valore nutrizionale o che sono troppo grandi per la digestione. In questi casi, l'eccesso viene espulso.
Gli squali spesso inghiottono tutto o in pezzi considerevoli. A causa di ciò, tutta la scomposizione deve avvenire nello stomaco a forma di U dello squalo. Alcuni squali, come il Great White, hanno estensioni nell'esofago che impediscono a cibo o prede di fuggire prima di raggiungere lo stomaco. Enzimi e altri acidi nello stomaco lavorano quindi per formare il materiale ingerito in una sostanza densa e fangosa che è pronta per essere digerita nell'intestino. È necessario che questo materiale da zuppa sia il più molle possibile, perché la valvola che porta dallo stomaco dello squalo al suo intestino, la valvola pilorica, è piuttosto piccola e non ammetterà altrimenti il materiale. Lo squalo è in grado di vomitare qualsiasi materiale, come le ossa, che non si rompono abbastanza facilmente da passare attraverso la valvola. I nutrienti vengono quindi assorbiti attraverso l'intestino dello squalo e gli scarti in eccesso vengono espulsi.
