La risposta alla luce nelle piante è una complessa serie di trigger e anelli di retroazione che utilizzano determinate proteine nella cellula per preparare ed elaborare la luce con conseguente crescita, fioritura e tensione verso la luce. Le proteine responsabili della risposta alla luce sono FHY3, FAR1, FHY1, FHL e phytochrome A.
Le piante iniziano a reagire all'assenza di luce producendo la coppia di proteine note come FHY3 e FAR1. Queste due proteine aumentano la produzione di un altro paio di proteine conosciute come FHY1 e FHL. La pianta immagazzina queste proteine in modo che sia in grado di rispondere alla luce non appena è disponibile. Una proteina nota come phytochrome A rileva la luce sull'estremo rosso dello spettro, dando inizio alla risposta della luce della pianta prima che gli umani possano vederla.
Quando il phytochrome A è attivato, si lega con FHY1 e FHL, il che si traduce nell'accumulo di phytochrome A nel nucleo della cellula. Il Phytochrome A regola l'attività dei geni nel nucleo cellulare responsabile dello sviluppo della pianta. Quando l'attività del gene cambia, la pianta risponde con crescita, fioritura o tensione verso la luce. Man mano che aumenta il phytochrome A nel nucleo, vengono prodotti meno FHY3 e FAR1, creando un ciclo di feedback negativo che limita la risposta alla luce della pianta.
