I coccodrilli si riproducono per copulazione. La copulazione si verifica generalmente nell'acqua e, in caso di fecondazione, il coccodrillo diventa incinta e depone le uova.
La copulazione del coccodrillo non avviene finché non si verifica un corteggiamento alquanto complesso. Il coccodrillo maschio si strofina il corpo contro la femmina e, se è ricettiva, fa vocalizzazioni in modo che sappia procedere.
Un coccodrillo femmina depone da 12 a 48 uova in un nido dopo l'accoppiamento. I coccodrilli del Nilo scavano una buca, poi depositano le uova e le riempiono di terra. I coccodrilli di acqua salata costruiscono un cumulo di terra e piante per depositare le uova.
Le uova si schiudono dopo 2 o 3 mesi, quando i coccodrilli sono completamente sviluppati.
